根据有关规定，中共中央纪委对中国农业银行股份有限公司原执行董事、副行长、党委委员杨琨严重违纪违法问题进行了立案检查。

经查，杨琨利用职务上的便利，为他人谋取利益，收受巨额贿赂。

杨琨的行为已构成严重违纪，并涉嫌受贿犯罪。依据《中国共产党纪律处分条例》，参照《行政机关公务员处分条例》的有关规定，经中央纪委审议并报中共中央批准，决定给予杨琨开除党籍处分；经监察部报国务院批准，决定给予其开除公职处分；收缴其违纪所得；将其涉嫌犯罪问题移送司法机关依法处理。